El futuro de toda institución científica depende de su portafolio de investigación y desarrollo, con lo cual no solo logra engrosar la cartera de productos sino abrir nuevos horizontes a la ciencia. Las agrupaciones de investigación y desarrollo del Instituto Finlay trabajan intensamente en el campo de la meningitis B, así como en otros proyectos, entre los que se destacan:
- Vacuna antitifoìdica de Polisacárido Vi.
- Vacuna Conjugada antimeningocòcica C.
- Vacuna contra el Haemofilus Influenzae b.
- Vacuna Anticòlera Atenuada.
- Vacuna Anticòlera Inactivada.
- Vacuna Anticòlera basada en Sub-Unidades.
- Vacuna contra la Pseudomonas Aeruginosa.
- Vacuna Antishigella.
- Vacuna Antihepatitis A.
- Vacuna DT antitifoìdica de Polisacárido Vi.
- Vacuna Antoamoeba.
- Vacuna DPT antimeningocòcica.
- Vacuna Antidengue.
- Vacuna contra la Tuberculosis. Desarrollo de Kits Diagnóstico.
- Vacuna Antileptospiròsica.
- Vacuna Antimeningocòcica. Mucosal (Estudios preclínicos. Patente en Proceso).
- Nueva Generación de Adyuvantes. Mucosal y Parenteral. (Investigación Básica. Patente en Proceso).
- Liberación Controlada (Investigación Básica).
- Vacuna antimeningocòcica AC (Estudios de Formulación. Patente en proceso).
- Th-I adyuvante. Vía parenteral. (Estudios Preclínicos. Patente en Proceso).